Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms