Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM52Q96A61 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms