Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTSSAQ969W0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms