Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6Q969F1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
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