Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A6Q92581 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms