Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms