Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHIPQ8WWQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHIPQ8WWQ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms