Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms