Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms