Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms