Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6DQ8NFY4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms