Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM3Q8NE01 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms