Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL3Q8ND23 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms