Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG2Q8NC44 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG2Q8NC44 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms