Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS3Q8IXF0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS3Q8IXF0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms