Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC117Q8IWD4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms