Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP1Q86W92 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP1Q86W92 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms