Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHA9Q7RTU4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms