Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP1Q702N8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP1Q702N8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms