Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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C9orf139Q6ZV77 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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C9orf139Q6ZV77 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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C9orf139Q6ZV77 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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