Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms