Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms