Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms