Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF6Q6KF10 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms