Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms