Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM236Q5W0B7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM236Q5W0B7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM236Q5W0B7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM236Q5W0B7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM236Q5W0B7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms