Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH4AQ5TD94 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms