Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC18Q5T9S5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC18Q5T9S5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms