Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDSS1Q5T2R2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms