Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FRMPD1Q5SYB0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD1Q5SYB0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms