Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms