Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms