Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms