Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP221Q4G0U5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms