Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL40Q2TBA0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms