Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGSM1Q2NKQ1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms