Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ISXQ2M1V0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms