Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM187BQ17R55 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms