Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCK2Q16822 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms