Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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