Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX1Q15699 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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