Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RYR3Q15413 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RYR3Q15413 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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RYR3Q15413 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RYR3Q15413 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RYR3Q15413 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RYR3Q15413 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RYR3Q15413 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RYR3Q15413 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RYR3Q15413 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RYR3Q15413 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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