Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHPRHQ149N8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
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