Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN1Q14699 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN1Q14699 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms