Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD11Q14690 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD11Q14690 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms