Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCINQ13939 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCINQ13939 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCINQ13939 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCINQ13939 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCINQ13939 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCINQ13939 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCINQ13939 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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CCINQ13939 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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CCINQ13939 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCINQ13939 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCINQ13939 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
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