Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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