Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1SQ13698 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1SQ13698 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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