Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1orf61Q13536 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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