Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms